Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.31■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.29■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.28■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
L1RE1Q9UN81 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms