Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ3

BARX2, Homeobox protein BarH-like 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX2Q9UMQ3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BARX2Q9UMQ3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms