Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM54

MYO6, Unconventional myosin-VI, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO6Q9UM54 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MYO6Q9UM54 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MYO6Q9UM54 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MYO6Q9UM54 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MYO6Q9UM54 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MYO6Q9UM54 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MYO6Q9UM54 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MYO6Q9UM54 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYO6Q9UM54 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYO6Q9UM54 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYO6Q9UM54 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYO6Q9UM54 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYO6Q9UM54 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYO6Q9UM54 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYO6Q9UM54 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYO6Q9UM54 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYO6Q9UM54 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms