Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK0

GRID1, Glutamate receptor ionotropic, delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID1Q9ULK0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRID1Q9ULK0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRID1Q9ULK0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRID1Q9ULK0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRID1Q9ULK0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRID1Q9ULK0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRID1Q9ULK0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRID1Q9ULK0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRID1Q9ULK0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRID1Q9ULK0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRID1Q9ULK0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRID1Q9ULK0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRID1Q9ULK0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GRID1Q9ULK0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRID1Q9ULK0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GRID1Q9ULK0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRID1Q9ULK0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRID1Q9ULK0 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRID1Q9ULK0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRID1Q9ULK0 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRID1Q9ULK0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRID1Q9ULK0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRID1Q9ULK0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRID1Q9ULK0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRID1Q9ULK0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRID1Q9ULK0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRID1Q9ULK0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRID1Q9ULK0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRID1Q9ULK0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GRID1Q9ULK0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRID1Q9ULK0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRID1Q9ULK0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GRID1Q9ULK0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRID1Q9ULK0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRID1Q9ULK0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms