Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ZNF608Q9ULD9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ZNF608Q9ULD9 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ZNF608Q9ULD9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ZNF608Q9ULD9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
ZNF608Q9ULD9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ZNF608Q9ULD9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ZNF608Q9ULD9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ZNF608Q9ULD9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
ZNF608Q9ULD9 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ZNF608Q9ULD9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms