Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL62

TRPC5, Short transient receptor potential channel 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC5Q9UL62 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRPC5Q9UL62 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRPC5Q9UL62 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRPC5Q9UL62 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
TRPC5Q9UL62 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TRPC5Q9UL62 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPC5Q9UL62 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRPC5Q9UL62 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRPC5Q9UL62 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRPC5Q9UL62 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms