Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms