Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ83

HACL1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACL1Q9UJ83 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HACL1Q9UJ83 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HACL1Q9UJ83 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HACL1Q9UJ83 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HACL1Q9UJ83 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HACL1Q9UJ83 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms