Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms