Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VTI1BQ9UEU0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VTI1BQ9UEU0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
VTI1BQ9UEU0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VTI1BQ9UEU0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VTI1BQ9UEU0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VTI1BQ9UEU0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VTI1BQ9UEU0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VTI1BQ9UEU0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VTI1BQ9UEU0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VTI1BQ9UEU0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VTI1BQ9UEU0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VTI1BQ9UEU0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VTI1BQ9UEU0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VTI1BQ9UEU0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VTI1BQ9UEU0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VTI1BQ9UEU0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VTI1BQ9UEU0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VTI1BQ9UEU0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VTI1BQ9UEU0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VTI1BQ9UEU0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VTI1BQ9UEU0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VTI1BQ9UEU0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VTI1BQ9UEU0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VTI1BQ9UEU0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VTI1BQ9UEU0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VTI1BQ9UEU0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
VTI1BQ9UEU0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VTI1BQ9UEU0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VTI1BQ9UEU0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VTI1BQ9UEU0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VTI1BQ9UEU0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VTI1BQ9UEU0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VTI1BQ9UEU0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VTI1BQ9UEU0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VTI1BQ9UEU0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VTI1BQ9UEU0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VTI1BQ9UEU0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VTI1BQ9UEU0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VTI1BQ9UEU0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VTI1BQ9UEU0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VTI1BQ9UEU0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VTI1BQ9UEU0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
VTI1BQ9UEU0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms