Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKX1-2Q9UD57 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms