Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRP2BPQ9P2M1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRP2BPQ9P2M1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRP2BPQ9P2M1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRP2BPQ9P2M1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRP2BPQ9P2M1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRP2BPQ9P2M1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRP2BPQ9P2M1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRP2BPQ9P2M1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRP2BPQ9P2M1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRP2BPQ9P2M1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRP2BPQ9P2M1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRP2BPQ9P2M1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRP2BPQ9P2M1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRP2BPQ9P2M1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LRP2BPQ9P2M1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRP2BPQ9P2M1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRP2BPQ9P2M1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRP2BPQ9P2M1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRP2BPQ9P2M1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LRP2BPQ9P2M1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRP2BPQ9P2M1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRP2BPQ9P2M1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRP2BPQ9P2M1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRP2BPQ9P2M1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRP2BPQ9P2M1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRP2BPQ9P2M1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRP2BPQ9P2M1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRP2BPQ9P2M1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRP2BPQ9P2M1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRP2BPQ9P2M1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRP2BPQ9P2M1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRP2BPQ9P2M1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LRP2BPQ9P2M1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRP2BPQ9P2M1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRP2BPQ9P2M1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRP2BPQ9P2M1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRP2BPQ9P2M1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRP2BPQ9P2M1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRP2BPQ9P2M1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRP2BPQ9P2M1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRP2BPQ9P2M1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRP2BPQ9P2M1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRP2BPQ9P2M1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRP2BPQ9P2M1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRP2BPQ9P2M1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms