Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms