Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNRD1Q9P1U0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms