Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms