Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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