Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK12Q9NYV4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms