Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT57Q9NWB7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms