Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLR3EQ9NVU0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR3EQ9NVU0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms