Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMSN1Q9NSI8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms