Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms