Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms