Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms