Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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LHX9Q9NQ69 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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LHX9Q9NQ69 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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LHX9Q9NQ69 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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