Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms