Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ3

DNAJC4, DnaJ homolog subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC4Q9NNZ3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJC4Q9NNZ3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms