Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms