Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms