Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 TYW3-205ENST00000479111 1130 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 C9orf85-203ENST00000377031 1107 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 AC129507.2-201ENST00000572499 748 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 NIFK-AS1-202ENST00000414554 1411 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms