Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSTN2Q9H4D0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms