Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms