Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNMDQ9H2S6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms