Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LHX5Q9H2C1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LHX5Q9H2C1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LHX5Q9H2C1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LHX5Q9H2C1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LHX5Q9H2C1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LHX5Q9H2C1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LHX5Q9H2C1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LHX5Q9H2C1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LHX5Q9H2C1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LHX5Q9H2C1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHX5Q9H2C1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHX5Q9H2C1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHX5Q9H2C1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHX5Q9H2C1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHX5Q9H2C1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHX5Q9H2C1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHX5Q9H2C1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHX5Q9H2C1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHX5Q9H2C1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LHX5Q9H2C1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHX5Q9H2C1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHX5Q9H2C1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LHX5Q9H2C1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHX5Q9H2C1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHX5Q9H2C1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHX5Q9H2C1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHX5Q9H2C1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHX5Q9H2C1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHX5Q9H2C1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHX5Q9H2C1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHX5Q9H2C1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LHX5Q9H2C1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LHX5Q9H2C1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LHX5Q9H2C1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LHX5Q9H2C1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LHX5Q9H2C1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LHX5Q9H2C1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
LHX5Q9H2C1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
LHX5Q9H2C1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LHX5Q9H2C1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LHX5Q9H2C1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
LHX5Q9H2C1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LHX5Q9H2C1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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