Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC90BQ9GZT6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms