Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE41Q9C0J9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms