Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H5

ARHGAP39, Rho GTPase-activating protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP39Q9C0H5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms