Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC4A5Q9BY07 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC4A5Q9BY07 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC4A5Q9BY07 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC4A5Q9BY07 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC4A5Q9BY07 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC4A5Q9BY07 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC4A5Q9BY07 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC4A5Q9BY07 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC4A5Q9BY07 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms