Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms