Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms