Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3BQ9BS92 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms