Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDF4Q9BRK5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms