Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms