Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRF8

CPPED1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPPED1Q9BRF8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CPPED1Q9BRF8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CPPED1Q9BRF8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CPPED1Q9BRF8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CPPED1Q9BRF8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CPPED1Q9BRF8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CPPED1Q9BRF8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CPPED1Q9BRF8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CPPED1Q9BRF8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CPPED1Q9BRF8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CPPED1Q9BRF8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CPPED1Q9BRF8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CPPED1Q9BRF8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CPPED1Q9BRF8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CPPED1Q9BRF8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CPPED1Q9BRF8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CPPED1Q9BRF8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms