Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms