Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TREX2Q9BQ50 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms