Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP1Q9BPW8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP1Q9BPW8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP1Q9BPW8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP1Q9BPW8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP1Q9BPW8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP1Q9BPW8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP1Q9BPW8 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP1Q9BPW8 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP1Q9BPW8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP1Q9BPW8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP1Q9BPW8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP1Q9BPW8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP1Q9BPW8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP1Q9BPW8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP1Q9BPW8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP1Q9BPW8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP1Q9BPW8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP1Q9BPW8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP1Q9BPW8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP1Q9BPW8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP1Q9BPW8 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPSNAP1Q9BPW8 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NIPSNAP1Q9BPW8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NIPSNAP1Q9BPW8 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NIPSNAP1Q9BPW8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NIPSNAP1Q9BPW8 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NIPSNAP1Q9BPW8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
NIPSNAP1Q9BPW8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NIPSNAP1Q9BPW8 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NIPSNAP1Q9BPW8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NIPSNAP1Q9BPW8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NIPSNAP1Q9BPW8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms