Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MEIS3Q99687 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms