Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RGPD5Q99666 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms