Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms