Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms